本部役員／事務局長 （令和6年9月1日現在）
- 機構長
- 木部 暢子
- 理事・機構長代理
（総務、財務担当） - 宮崎 恒二
- 理事
（研究、評価、教育担当） - 栗本 英世
- 理事
（情報、ＤＨ担当） - 堀 浩一
- 理事（非常勤）
（広報、社会連携、国際交流担当） - 若尾 政希
- 監事
- 井野瀬 久美惠
- 監事（非常勤）
- 井上 東
- 事務局長
- 井上 賢一
役員・職員数 （2023年5月1日現在）
単位：人
| 機関 | 役 員 |
館 ･ 所 長 |
常勤教員・研究員 | 非常勤教員・研究員 | 事務・技術職員 （常勤・非常勤） |
||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 研究教育 職員 |
特任 研究員 |
外国人 研究員 |
客員教員 （国内） |
非常勤 研究員等 |
|||||
| 機構本部 | 7 | 0 | 0 | 28 | 0 | 1 | 0 | 39 | (1) |
| 国立歴史民俗 博物館 |
0 | 1 | 40 | 4 | 0 | 2 | 5 | 123 | (2) |
| 国文学 研究資料館 |
0 | 1 | 24 | 5 | 0 | 1 | 11 | 161 | (1) |
| 国立国語 研究所 |
0 | 1 | 22 | 4 | 0 | 8 | 62 | 87 | (3) |
| 国際日本文化 研究センター |
0 | 1 | 22 | 1 | 11 | 11 | 15 | 89 | (0) |
| 総合地球 環境学研究所 |
0 | 1 | 18 | 6 | 0 | 1 | 33 | 85 | (0) |
| 国立民族学 博物館 |
0 | 1 | 53 | 1 | 1 | 0 | 12 | 163 | (5) |
| 計 | 7 | 6 | 179 | 49 | 12 | 24 | 138 | 747 | (12) |
（ ）内は再任用職員数で内数